冷凍干燥機自控系統設計要求操作簡便，從物料放入按鈕開機，速凍真空升華干燥一氣呵成，提示凍干完成后關機出料。有關的溫度、壓力控制點要精心選擇、合理控制，速凍、真空保持、加熱的關聯應控制恰當，針對不同的物料設置工藝曲線。
　　冷凍干燥機由制冷系統、真空系統、加熱系統、電器儀表控制系統所組成。那么冷凍干燥機有哪些好處呢下面我們來看看：
　　1、冷凍干燥在低溫下進行因此對于許多熱敏性的物質特別適用。如蛋白質、微生物之類不會發生變性或失去生物活力。因此冷凍干燥機在醫藥上得到廣泛地應用。
　　2、由于在凍結的狀態下進行冷凍干燥機干燥因此體積幾乎不變保持了原來的結構不會發生濃縮現象。
　　3、冷凍干燥機干燥后的物質疏松多孔呈海綿狀加水后溶解迅速而*幾乎立即恢復原來的性狀。
　　4、由于冷凍干燥機干燥在真空下進行氧氣極少因此一些易氧化的物質得到了保護。
　　5、冷凍干燥機在低溫下干燥時物質中的一些揮發性成分損失很小適合一些化學產品藥品和食品干燥。
　　6、在冷凍干燥過程中微生物的生長和酶的作用無法進行因此能保持原來的性裝。
　　7、冷凍干燥機干燥能排除95-99%以上的水份使干燥后產品能長期保存而不致變質。
　　8、由于物料中水分在預凍以后以冰晶的形態存在，原來溶于水中的無機鹽類溶解物質被均勻地分配在物料之中；
　　9、冷凍干燥機干燥后的物質疏松多孔，呈海綿狀，加水后溶解迅速而*，幾乎立即恢復原來的性狀；
　　10、由于干燥在真空下進行，氧氣極少，因此一些易氧化的物質進行冷凍干燥機干燥得到了保護。